El nombre del barrio se debe a que existió una ermita de San Cristóbal en la zona, que se derribó en los años 50. Albergó un tríptico, llamado de San Cristóbal, que hoy se encuentra en el Museo Diocesano de Arte Sacro de Las Palmas de Gran Canaria.
Hasta el siglo XIX, San Cristóbal apenas tiene referencias documentales. Esto es así porque con anterioridad los terratenientes despreciaban las tierras próximas al mar y construían de espaldas a él.
Los primeros habitantes del barrio fueron los vigilantes del llamado Castillo de San Cristóbal, que adoptaron la pesca como el mejor medio de obtener sustento.
El verdadero nombre del castillo es Torre de San Pedro Mártir, y fue construida en 1578. Era una de las fortificaciones que integraban la red de protección de la isla. Gran Canaria sufrió muchos ataques piratas, siendo los más célebres los del inglés Drake, que fue rechazado (1595), y del holandés Van Der Does, que saqueó la ciudad (1599). Ambos dañaron la torre, que se reconstruyó en 1638.
La torre se construyó sobre una gran roca marina, y con la marea alta queda aislada de la playa. Es un Monumento Histórico Artístico protegido, y uno de sus antiguos cañones se exhibe en el Museo de Colón.
San Cristóbal alberga hoy toda una joya de la cultura insular: la que es la última carpintería de ribera o la fabricación artesanal de embarcaciones de madera.
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